蛋白中色氨酸和酪氨酸荧光受其所在微环境的影响很大，尤其是色氨酸荧光，蛋白结构的变化通常会影响其强度和发射波长。PR NT.48 仪器配备的荧光检测器可测定样品在两种波长（350 nm 和 330 nm）下的荧光强度，因而可以灵敏的检测到蛋白去折叠过程中荧光强度和荧光峰值的变化。
通过变性曲线可以得到蛋白稳定性的重要参数。衡量目标蛋白的热稳定性可通过参数熔融温度（Tm），即一半蛋白去折叠时的温度。Tm值可根据色氨酸单荧光强度变化计算，也可以通过色氨酸在 330nm 和 350nm 发散波长下荧光比值计算。
通过 F350 / F330 比值所获得的数据通常可以清晰的描述蛋白去折叠的转变过程，但有时单波长的检测数据并不能导出 Tm 值，而 PR NT.48 双波长检测系统则可以灵敏检测蛋白的去折叠过程。
